I perioden 1860 - 68 tog eleverne fra Sønderho til Nordby for at tage deres nautiske eksamener. 

I 1868 oprettede den velbegavede og dygtige skibsfører Jes H. Schmidt en navigationsskole i Sønderho. I de 4 første år undervistes der kun om vinteren. Skolen havde ikke eksamensret, eleverne skulle indstille sig til eksamen ved skolen i Nordby og fra 1882 måtte de gå de sidste 2 måneder på Fanø Navigationsskole for at opnå den økonomiske støtte som skolen ydede til "fremmede elever". I 1892 måtte Schmidt lukke sin skole, idet navigationsskolen i Nordby fik ny bestyrer, der ikke ønskede at opretholde samarbejdet med skolen i Sønderho og der kunne ikke længere forventes statsstøtte til skolen.

I de sidste 5 år før skolen i Sønderho måtte lukke var Niels Jepsen Nielsen hyret som medhjælper. Han var født i 1845 i Sønderho, og havde i mange år opholdt sig i Amerika. Efter sin hjemkomst blev han uddannet som navigationslærer. Senere rejste han tilbage til Amerika, hvor han døde i Brooklyn. N. A. Vodder, først lærer ved navigationsskolen i Nordby, var også Schmidts hjælper i flere år.

Sidst i 1870'erne og til omkring 1884 gav M. C. Thodsen undervisning i navigationslære på Fanø. Han havde indrettet lokale i en ejendom i Rindby, og havde ikke så få elever, der indstillede sig til eksamen på Fanø Navigationsskole. Thodsen døde i København1892.

Thodsens hus i Rindby