Det første forsøg på at oprette en navigationsskole på Fanø blev gjort i 1799 af skibsfører Niels Michelsen af Sønderho. Han havde ikke selv bestået nogen eksamen, men havde i mange år sejlet med hollandske skibe, og senere været skipper på sit eget skib, som han mistede ved forlis i 1795. Han ansøger 5. januar 1799 Admiralitetskollegiet om at få sin skole autoriseret.

To af hans elever, Mads Hansen Ibsen og Hans Jørgen Anthonisen medgiver hans ansøgning den erklæring, at de efter at have modtaget undervisning i navigation hos ham har taget eksamen i København hos professor Lous med et fint resultat. Også hans udmærkede evner til at undervise giver de to eksaminerede navigatører, skipperne Hans Thomsen og Niels Callesen Pedersen ham attest for. Øens birkedommer, hr. Engelstoft, giver ham ligeledes den bedste anbefaling. Michelsen indstiller sig nu for at aflægge prøve i sine kundskaber hos navigationsdirektør, professor C. C. Lous, der erklærer ham "for at være en dygtig Skipper og Sømænd, hvis Elever, der har været fremstillet til Eksamen hos ham, har været veluddannet, hvorfor det kan anbefales ham Tilladelse til at oprette en Navigationsskole i Sønderho". 

Den 20. juni 1800 fik han tilladelse til at oprette en navigationsskole i Sønderho - "naar han bruger den samme Undervisningsmetode som i København og anvender Lous' Skatkammer samt nøje paaser, at de informerende lærer færdighed i at regne: 

1.       Høj- og Lavvande ud ved ru og Korrekt Regning

2.       Poli Højde ved Solen om Middag og Midnat

3.       Solens Middagshøjde og derefter at stille Kvadranten eller Oktanten

4.       Poli Højde ved Stjernerne

5.       Misvisning ved Aften- og Morgenpejling

6.       Misvisningen ved en Pejling op- eller nedgaaende

7.       Misvisning ved en Azimith Pejling

8.       At stille og forbedre Kurs

9.       At regne Strømkrøbling med og mod Strømmen

10.   Et stykke af det platte eller voksende Korts regning, hvilket de informerende læres

11.   At passe i det platte og voksende Kort de fornødne Vækststykker og

12.   At regne Bestik efter Marinekalenderen saaledes som paa vor Klode bruges"

Michelsen fik dog ikke ret til at udstede eksamensbeviser, eleverne skulle indstille sig til eksamen enten i København eller i Tønning. 

Undervisningen foregik om vinteren, mens Michelsen sejlede om sommeren, men nu som styrmand, idet han ikke længere havde eget skib. 

Undervisningen fik et brat stop, idet Michelsen i sommeren 1806 sejlede som styrmand med skipper Hans Peder Jensen fra Sønderho. På sidste rejse hjem til Fanø strandede skibet ved Amrum 28. november og Michelsen omkom ved strandingen.

Regneark fra navigationsundervisningen